120份水稻自然群体材料穗瘟抗性的全基因组关联分析开题报告

 2023-02-15 10:12:21

1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)

意义:

水稻是重要的粮食作物。稻瘟病是全世界水稻主栽区发生最严重的病害之一,平均每年因稻瘟病造成的水稻产量损失可供6千万人食用[1],由于稻瘟病菌存在广泛的变异,所以防治稻瘟病最经济安全的方法是培育含稻瘟病持久抗性基因的新品种[2],但是传统的常规育种年限较长,虽然随着分子标记辅助选择技术的飞快发展并应用于水稻抗稻瘟病育种当中[3],但是目前仅定位和克隆了1个穗瘟抗性基因,我们急需发掘新的稻瘟病(穗瘟)抗性基因,以满足稻瘟病研究和水稻抗病育种需求[4]

国内外研究概况:

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2. 研究的基本内容和问题

本课题研究目标:

希望找到与稻瘟病穗瘟相关的基因,为基因克隆和水稻抗稻瘟病遗传育种打下基础,缩短育种年限。

内容:

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3. 研究的方法与方案

研究方法:水稻穗瘟鉴定标准体系的建立

(1) 接种时间:阴天或傍晚;剑叶与倒二叶叶舌间距为5cm左右

(2) 孢子液浓度:2-3105个/ml(刘水芳等,2007)

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4. 研究创新点

1.节省时间。本实验是用表型数据直接找到相关的基因,大大缩短的时间,这一点对于育种工作人员来说是一次很大的改进。当然在此期间我们能省下很多劳动力,避免实验期间的误差等。

2.找到新的稻瘟病穗瘟相关联的基因。通过分析数据找到SNP位点,对每个位点左右100Kb以内的基因进行分析,在这些基因中不仅包括已经被克隆的基因也有很多尚未克隆的基因,因此可能会有新基因发现。

5. 研究计划与进展

主要的研究计划和预期进展:

通过采用不同方法对数据进行分析比较找到与稻瘟病穗瘟相关的基因,并对新的基因进行功能验证,同时希望找到与稻瘟病穗瘟相关的基因,不仅要有已经被克隆的还要有没有被发现的基因。

具体的是:

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